Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rabep1O35551 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rabep1O35551 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rabep1O35551 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rabep1O35551 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rabep1O35551 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rabep1O35551 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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