Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccrl2O35457 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccrl2O35457 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccrl2O35457 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccrl2O35457 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccrl2O35457 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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