Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Abcc1O35379 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Abcc1O35379 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Abcc1O35379 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Abcc1O35379 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Abcc1O35379 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Abcc1O35379 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Abcc1O35379 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Abcc1O35379 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Abcc1O35379 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc1O35379 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc1O35379 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc1O35379 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Abcc1O35379 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc1O35379 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abcc1O35379 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms