Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hs3st1O35310 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hs3st1O35310 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hs3st1O35310 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hs3st1O35310 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hs3st1O35310 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hs3st1O35310 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms