Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Casq1O09165 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casq1O09165 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casq1O09165 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casq1O09165 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casq1O09165 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casq1O09165 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casq1O09165 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casq1O09165 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casq1O09165 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Casq1O09165 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casq1O09165 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Casq1O09165 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Casq1O09165 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casq1O09165 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Casq1O09165 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Casq1O09165 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Casq1O09165 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Casq1O09165 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Casq1O09165 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Casq1O09165 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Casq1O09165 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Casq1O09165 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Casq1O09165 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Casq1O09165 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Casq1O09165 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Casq1O09165 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Casq1O09165 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.53■■■□□ 2
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