Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb6O08644 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb6O08644 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb6O08644 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ephb6O08644 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb6O08644 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb6O08644 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb6O08644 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb6O08644 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb6O08644 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms