Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efna5O08543 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Efna5O08543 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Efna5O08543 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efna5O08543 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Efna5O08543 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Efna5O08543 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Efna5O08543 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Efna5O08543 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efna5O08543 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Efna5O08543 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efna5O08543 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efna5O08543 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Efna5O08543 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Efna5O08543 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Efna5O08543 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efna5O08543 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efna5O08543 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efna5O08543 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efna5O08543 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efna5O08543 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efna5O08543 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efna5O08543 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efna5O08543 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Efna5O08543 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms