Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ccdc191J3QQ27 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ccdc191J3QQ27 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc191J3QQ27 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Ccdc191J3QQ27 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ccdc191J3QQ27 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc191J3QQ27 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc191J3QQ27 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,4 ms