Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm4791J3QQ14 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm4791J3QQ14 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm4791J3QQ14 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4791J3QQ14 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4791J3QQ14 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms