Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Fam240aJ3QNP9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Fam240aJ3QNP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Fam240aJ3QNP9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16,9■□□□□ 0,3
Fam240aJ3QNP9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Fam240aJ3QNP9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Fam240aJ3QNP9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Fam240aJ3QNP9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16,86■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16,86■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,85■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16,84■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16,83■□□□□ 0,29
Fam240aJ3QNP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16,83■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,82■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16,81■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,81■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,79■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16,79■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,78■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16,78■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,78■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16,77■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Fam240aJ3QNP9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,77■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16,73■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,73■□□□□ 0,27
Fam240aJ3QNP9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms