Protein–RNA interactions for Protein: J3QN52

Gm16427, Predicted gene 16427, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16427J3QN52 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm16427J3QN52 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm16427J3QN52 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm16427J3QN52 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm16427J3QN52 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm16427J3QN52 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm16427J3QN52 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm16427J3QN52 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm16427J3QN52 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm16427J3QN52 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm16427J3QN52 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm16427J3QN52 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms