Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34c3J3QJW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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