Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r67G5E8C1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r67G5E8C1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r67G5E8C1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms