Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r58G3X9U3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms