Protein–RNA interactions for Protein: F8VQH7

Dbx2, Developing brain homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx2F8VQH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dbx2F8VQH7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dbx2F8VQH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dbx2F8VQH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dbx2F8VQH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms