Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srp72F8VQC1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srp72F8VQC1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srp72F8VQC1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp72F8VQC1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp72F8VQC1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms