Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sptbn5F6UCX4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sptbn5F6UCX4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sptbn5F6UCX4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sptbn5F6UCX4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sptbn5F6UCX4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sptbn5F6UCX4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.9 ms