Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm29094F6Q785 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gm29094F6Q785 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm29094F6Q785 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm29094F6Q785 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm29094F6Q785 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm29094F6Q785 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm29094F6Q785 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm29094F6Q785 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm29094F6Q785 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm29094F6Q785 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm29094F6Q785 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm29094F6Q785 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms