Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
2610001J05RikF2Z3Y9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms