Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U2

Speer2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer2E9Q9U2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer2E9Q9U2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer2E9Q9U2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer2E9Q9U2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer2E9Q9U2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer2E9Q9U2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer2E9Q9U2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer2E9Q9U2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Speer2E9Q9U2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer2E9Q9U2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer2E9Q9U2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer2E9Q9U2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms