Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5407E9Q7Q1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5407E9Q7Q1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5407E9Q7Q1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5407E9Q7Q1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5407E9Q7Q1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5407E9Q7Q1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5407E9Q7Q1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5407E9Q7Q1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5407E9Q7Q1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5407E9Q7Q1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5407E9Q7Q1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms