Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srsf11E9Q6E5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srsf11E9Q6E5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srsf11E9Q6E5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srsf11E9Q6E5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srsf11E9Q6E5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srsf11E9Q6E5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srsf11E9Q6E5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srsf11E9Q6E5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms