Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930579F01RikE9Q3L6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms