Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Susd1E9Q3H4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Susd1E9Q3H4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd1E9Q3H4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Susd1E9Q3H4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Susd1E9Q3H4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms