Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930523C07RikE9Q2T4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
4930523C07RikE9Q2T4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
4930523C07RikE9Q2T4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
4930523C07RikE9Q2T4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
4930523C07RikE9Q2T4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
4930523C07RikE9Q2T4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
4930523C07RikE9Q2T4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
4930523C07RikE9Q2T4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
4930523C07RikE9Q2T4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
4930523C07RikE9Q2T4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms