Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krtap11-1E9Q2E9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap11-1E9Q2E9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krtap11-1E9Q2E9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap11-1E9Q2E9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms