Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3250E9Q1M3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3250E9Q1M3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3250E9Q1M3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3250E9Q1M3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3250E9Q1M3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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