Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc144bE9PVZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc144bE9PVZ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc144bE9PVZ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms