Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5286E0CXI6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5286E0CXI6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5286E0CXI6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5286E0CXI6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5286E0CXI6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms