Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28043E0CXC2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28043E0CXC2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28043E0CXC2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm28043E0CXC2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28043E0CXC2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms