Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgfbr3lD3YZZ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tgfbr3lD3YZZ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms