Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn24D3YXJ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn24D3YXJ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn24D3YXJ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn24D3YXJ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn24D3YXJ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn24D3YXJ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn24D3YXJ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn24D3YXJ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn24D3YXJ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn24D3YXJ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn24D3YXJ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn24D3YXJ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms