Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3259D3YUK0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3259D3YUK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3259D3YUK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3259D3YUK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3259D3YUK0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3259D3YUK0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms