Protein–RNA interactions for Protein: B8JJZ9

Zfp563, Zinc finger protein 563, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp563B8JJZ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp563B8JJZ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp563B8JJZ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp563B8JJZ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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