Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A930018M24RikB7ZMY3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A930018M24RikB7ZMY3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A930018M24RikB7ZMY3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A930018M24RikB7ZMY3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A930018M24RikB7ZMY3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A930018M24RikB7ZMY3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A930018M24RikB7ZMY3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A930018M24RikB7ZMY3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A930018M24RikB7ZMY3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A930018M24RikB7ZMY3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A930018M24RikB7ZMY3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A930018M24RikB7ZMY3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A930018M24RikB7ZMY3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A930018M24RikB7ZMY3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms