Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pnldc1B2RXZ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnldc1B2RXZ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnldc1B2RXZ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnldc1B2RXZ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms