Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cped1B2RX70 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cped1B2RX70 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cped1B2RX70 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cped1B2RX70 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cped1B2RX70 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cped1B2RX70 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms