Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AU015836B2RUM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AU015836B2RUM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AU015836B2RUM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AU015836B2RUM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms