Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Proca1B0QZF7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Proca1B0QZF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Proca1B0QZF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Proca1B0QZF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Proca1B0QZF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Proca1B0QZF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms