Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap221A9Q751 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap221A9Q751 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cfap221A9Q751 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap221A9Q751 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap221A9Q751 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms