Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm16430A6X8J1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm16430A6X8J1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm16430A6X8J1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm16430A6X8J1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm16430A6X8J1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm16430A6X8J1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms