Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SktA2AQ25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SktA2AQ25 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SktA2AQ25 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SktA2AQ25 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SktA2AQ25 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.2 ms