Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin3aA2AIR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3aA2AIR5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin3aA2AIR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin3aA2AIR5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin3aA2AIR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3aA2AIR5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms