Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930447F04RikA2AFR2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447F04RikA2AFR2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms