Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5938A2AEN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5938A2AEN9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5938A2AEN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5938A2AEN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5938A2AEN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5938A2AEN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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