Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700023F06RikA2AB62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
1700023F06RikA2AB62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700023F06RikA2AB62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700023F06RikA2AB62 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700023F06RikA2AB62 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700023F06RikA2AB62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms