Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdc27A2A6Q5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdc27A2A6Q5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc27A2A6Q5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc27A2A6Q5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc27A2A6Q5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms