Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933424G06RikA0A140LIP3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933424G06RikA0A140LIP3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms