Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms