Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28919A0A087WP35 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28919A0A087WP35 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28919A0A087WP35 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28919A0A087WP35 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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